药品检验涉及药学、化学、生物学、物理学、医学、动物学等学科，药品检验机构建设关键在于实验室的规划与设计。

药检所实验室布局规划设计：一是同类实验室，工程管网较多的实验室以及有洁净要求的实验室组合在一起;二是将有隔振要求的实验室设置于底层;三是把有毒性物质产生的实验室组合在一起;四是实验室尽量靠窗设置，确保足够的自然采光。药化分析实验室、动物实验室、中心库房、排污处理站(含焚烧室)等设施的规划建设，按独立、分散式规划设计。

药检所实验室公共系统设计：把实验室建设成公共实验“平台”，建立统一管理模式。将实验室系统设置为:药化分析实验室、仪器分析实验室、微生物实验室、植化分析室、标准室(含标准物质)、加热室、样品预处理室、CL级动物实验室、制水站、应急治疗室、中心库房及污水处理站等

药物分析实验室使用仪器设备：一些仪器自带水平仪，如分析天平、半微量天平和微量天平，大型分析仪器对地面的水平要求更高。地面水平工程在实验室工程设计与施工中应列入重点内容，在进行地面装修之前，基础应保证水平，地面完工后必须保持水平，如果地面上另建实验台，台面一定要达到水平。 

实验室要求防尘防噪防震设施：实验室防尘、防噪音、防震三防工程是实验室建设中的设计重点。防止尘埃污染主要是与外界进行有效隔断，对尘埃有PPM级要求的微生物实验室要采用净化空气。实验室的噪音源很多且强度各异，如空调机房、HPLC泵、GC的电动空气泵、超声震荡器、离心机等。吸音板、隔声室和消音器的混合使用对较宽频率范围内的噪音有良好的消声效果，另外，设计不低于2.0m宽的走廊也是降低嗓音传播途径的有效措施。防震工程在土建规划设计时把实验室设置在底层，并对相关设施进行再处理，针对电子显微镜室、微量天平和超微量天平实验室防震设计，要将室内地面凿开，独立建造实验台基础。

实验室净化通风系统：净化实验室设独立的操作间和公共净化走廊，在保证适应工作的前提下，应尽量减少建筑面积，合理布置人物流通道，做到独立设置、避免交叉和顺而不逆。净化空调机组送回风管道应有效隔断。普通实验室均设计为空调送风，产气、产尘量大的化学分析室以自然通风和机械通风的方式进行全室排风;植化分析室、中心库房、HPLC室、GC室、AA室等功能间采用局部排风，排风口设在污染源附近。 

除此之外，还应做好实验室，供电，照明，制水，废水处理，和应急系统，动物实验室还要做好防虫害，药品检验和科研的实验动物实际上是一个“活仪器”和“活试剂”。根据实验动物微生物控制标准为二级即清洁动物(CL)，其饲育环境为半屏蔽系统，空气洁净级别为C级。动物实验室设计应遵循独立选址原则，要求与其他实验设施分离建设，所处位置应僻静、卫生无污染;遵循人、物流、动物流分设的原则，一般设准备区、饲育区、实验区;房间要求净化、灭菌、防虫，实验室供水应符合饮用水和纯化水标准。